SD Muhammadiyah Purwokerto Kecamataan Purwokerto Utara berdiri tahun 1952, semula berdomisili disebelah utara Masjid Agung Baitussalam Purwokerto. Kemudian pindah di komplek SMA Muhammadiyah 1 Purwokerto tahun 1969. Kemudian berstatus MIM dari tahun 1973-1978. Pada tahun 1979 MIM Kembali menjadi SD Muhammadiyah Purwokerto lagi dengan alasan untuk praktek siswa SPG Muhammadiyah Purwokerto. Mulai tahun 1987 SD Muhammadiyah Purwokerto berdomisili di Jalan Karang Kobar Gang Gunung Gede No.950 Kelurahan Bancarkembar Kecamatan Purwokerto Utara.

Sejarah singkat yang penulis paparkan dari hasil wawancara kami dengan pendahulu yang sempat kami datangi yaitu :
1) Bapak H. Muflih Sugito (Purwokerto)
2) Ibu Hj. Lasmini Handoyo (Purwokerto)
3) Bapak H. Sutarno, BA (Banjarnegara)

Kegiatan belajar mengajar dari awal tahun berdiri sampai sekarang cukup lancar dan ada beberapa alumnus SD Muhammadiyah Purwokerto Kecamatan Purwokerto Utara telah menjadi Sarjana Pendidikan, Sarjana hukum, dan sebagainya, walau demikian ada yang putus sekolah.